עוסק במורשת היהודית ביפו ומתמקד בסיפורה הלא מוכר של העלייה מצפון אפריקה שהגיעה לארץ ישראל באמצע המאה ה-19 והקימה ביפו קהילה "ייחודית בשליחותה"
שרכשה אדמות צפונית ליפו כדי להקים עליהן עיר עברית, שנטעה את הפרדס העברי הראשון וחידשה את החקלאות היהודית בארץ ישראל, סייעה בהקמת מקווה ישראל ופתח תקווה, קלטה את אנשי העלייה הראשונה, סייעה ליוותה אותם בהקמת המושבות הראשונות, והניחה את התשתית הראשונית להפיכתה של יפו משער כניסה למרכז ציוני ממנו צומחת מדינת ישראל .
המרכז עוסק במחקר ובהנחלת המורשת החשובה והנשכחת של העלייה והקהילה ביפו דרך סיורים, הרצאות, סרטים וכתבות.